Опубликовано CodonCode Corporation на
2 Nov 2010
-
Размер файла
34.18 MB -
Лицензия
Коммерческий -
OC
Mac OS, Windows -
Цена
$720 Купить полную версию -
Автор
CodonCode Corporation -
Обновление
2 Nov 2010 -
Загрузок
102 (1 прошлой неделе)
"Удобная последовательность сборки и выравнивания"
CodonCode Aligner - это удобное в использовании программное обеспечение для сборки последовательности ДНК, выравнивания, редактирования контигов и обнаружения мутаций. В дополнение к функциям, общим для программ сборки последовательностей, таким как отсечение концов, выравнивание по ссылочным последовательностям, выравнивание кДНК по геномной ДНК и экспорт, CodonCode Aligner предлагает множество уникальных функций, которых нет в других программах.Расширенные функции CodonCode Aligner включают в себя:
- Собрать по имени: построить сотни contigs в считанные секунды, на основе имен образцов
- Точные согласованные последовательности, основанные на качествах последовательности, устраняют необходимость редактировать тривиальные расхождения
- Контиги контигов: выровняйте контиги друг с другом с помощью ClustalW и вернитесь к базовым трассам простым двойным щелчком мыши.
- Автоматизация с помощью одношаговой обработки и скриптов
- Чувствительный мутационный анализ с уникальными инструментами для анализа гетерозиготных вставок и делеций
- Используйте ведущие инструменты, такие как Clustal, MUSCLE, Phred & Phrap в CodonCode Aligner
- Получите лучшее представление о ваших последовательностях ABI с помощью резкости трассировки CodonCode Aligner.
- Посмотрите на различия с помощью таблицы различий и увеличения Contigs
- Построить соседние деревья, чтобы отсортировать образцы по различиям
CodonCode Aligner прост в освоении и использовании, но в то же время мощный и легко настраиваемый. Он включает в себя обширную, контекстно-зависимую справку с инструкциями «как делать» и пояснения об используемых алгоритмах. CodonCode Aligner широко используется в филогенетике, исследованиях эволюции, биогеографии, обнаружении мутаций и других областях биомедицинских исследований.
Загрузка является пробной версией, которая полностью функциональна в течение 30 дней. Его можно конвертировать в полную версию, купив лицензию. Лицензии на CodonCode Aligner существенно дешевле, чем лицензии на сопоставимые программные пакеты. «Плавающие» лицензии доступны без дополнительной оплаты и могут быть разделены между Windows и Mac OS X.
Требования: Windows 2000 or newer, Mac OS X 10.4 or newer
Что нового в этой версии: New: Neighbor-Joining trees Zooming in alignments & assemblies Automatic reference sequence shortening after alignments Mask low coverage regions New and flexible consensus methods Set base numbers Automatic name scheme definitions for "Assemble & Align by Name" Customize toolbars directly through popup menus Rebuild the consensus See http://www.codoncode.com/aligner/new.htm
Антивирус информации
Download3k скачал и испытаны CodonCode Aligner Sequence Assembler, 22 May 2012 года с некоторыми из лучших антивирусных ядер настоящее время и вы можете найти ниже, для вашего удобства, результаты проверки:
-
Avira:
Чистый -
Bitdefender:
Чистый -
Kaspersky:
Чистый -
NOD32:
Чистый